27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2153 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2153  SpoVT/AbrB domain protein  100 
 
 		 75 aa  142  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  47.69 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  41.89 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  47.14 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  43.48 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  42.03 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.49 
 
 		 74 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  37.84 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.49 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.28 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  37.14 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.43 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.43 
 
 		 74 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  41.54 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.06 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.5 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  43.08 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.14 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40 
 
 		 74 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.44 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.71 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.21 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  34.67 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  38.67 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.31 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.31 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.67 
 
 		 76 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>