33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1258 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 73 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  52.05 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  51.39 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.95 
 
 		 73 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  49.32 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.95 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  46.58 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.37 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.3 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  43.84 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.24 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.24 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  48.48 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0559  AbrB family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0558  AbrB family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  49.25 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  44.93 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  42.47 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.54 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  47.14 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40.58 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.48 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  44.29 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  39.13 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  38.57 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  43.84 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.25 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3137  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.25 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.94 
 
 		 74 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2153  SpoVT/AbrB domain protein  43.06 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  37.84 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4109  SpoVT/AbrB-like  30.56 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.462334  normal  0.998914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0353  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.06 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>