36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6861 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 74 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  58.9 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  55.41 
 
 		 74 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  50 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  52.7 
 
 		 73 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  54.05 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  54.05 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  54.05 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  52.7 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.65 
 
 		 73 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  51.39 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  50 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  51.39 
 
 		 74 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  46.58 
 
 		 74 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.67 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  42.47 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  43.24 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.54 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3137  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.54 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408099 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  44.59 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.65 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.3 
 
 		 73 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  45.95 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  32.43 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.36 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.79 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4296  hypothetical protein  37.14 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4123  hypothetical protein  35.71 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2153  SpoVT/AbrB domain protein  41.43 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0559  AbrB family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 76 aa  47.8  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0558  AbrB family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 76 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4109  SpoVT/AbrB-like  33.33 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.462334  normal  0.998914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3452  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.48 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0567  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  52.94 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>