27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3452 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3452  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 
98 aa  196  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117604  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4296  hypothetical protein  74.32 
 
 
74 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4123  hypothetical protein  72.97 
 
 
74 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  41.89 
 
 
75 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  44.59 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  42.86 
 
 
86 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  41.43 
 
 
74 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  46.58 
 
 
73 aa  57  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  40 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.14 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  35.14 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.14 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  35.14 
 
 
74 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.29 
 
 
74 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.88 
 
 
74 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  31.43 
 
 
75 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.23 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  35.71 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  36.49 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  35.71 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.43 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4109  SpoVT/AbrB-like  37.14 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.462334  normal  0.998914 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.23 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.43 
 
 
74 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.33 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.86 
 
 
73 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.78 
 
 
73 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>