33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0218 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  100 
 
 
74 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  67.57 
 
 
74 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  67.57 
 
 
74 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  65.33 
 
 
75 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  58.11 
 
 
74 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  65.67 
 
 
73 aa  94.7  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  63.38 
 
 
73 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  56.76 
 
 
74 aa  92.8  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  64.18 
 
 
73 aa  92.8  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  62.32 
 
 
73 aa  91.3  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  64.18 
 
 
73 aa  91.3  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  62.69 
 
 
73 aa  90.9  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  55.41 
 
 
74 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  54.05 
 
 
74 aa  88.6  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  54.67 
 
 
75 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  53.33 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  50.7 
 
 
73 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  54.17 
 
 
74 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 
74 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  47.3 
 
 
86 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.85 
 
 
73 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3137  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.85 
 
 
73 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.408099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.89 
 
 
74 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44.44 
 
 
74 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.06 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  49.25 
 
 
73 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4109  SpoVT/AbrB-like  39.44 
 
 
75 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.462334  normal  0.998914 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2153  SpoVT/AbrB domain protein  43.48 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84509  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.3 
 
 
73 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4123  hypothetical protein  32.86 
 
 
74 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4296  hypothetical protein  32.86 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3452  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  35.14 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117604  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>