35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8344 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  100 
 
 		 74 aa  150  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  72.97 
 
 		 74 aa  113  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  67.57 
 
 		 74 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  65.33 
 
 		 75 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  63.51 
 
 		 74 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  60.81 
 
 		 74 aa  98.2  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  59.46 
 
 		 74 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  61.33 
 
 		 75 aa  93.2  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  52.7 
 
 		 74 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  60.87 
 
 		 73 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  58.67 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  60.87 
 
 		 73 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  60.87 
 
 		 73 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  60.87 
 
 		 73 aa  88.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  57.97 
 
 		 73 aa  87.4  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  56.16 
 
 		 73 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  53.52 
 
 		 73 aa  83.6  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  52.05 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.65 
 
 		 74 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4109  SpoVT/AbrB-like  45.83 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.462334  normal  0.998914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.24 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3137  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.99 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2153  SpoVT/AbrB domain protein  47.69 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.99 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.48 
 
 		 73 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.78 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.67 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  46.97 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.19 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.42 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2185  hypothetical protein  36.84 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0559  AbrB family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0558  AbrB family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2955  hypothetical protein  32.14 
 
 		 68 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4123  hypothetical protein  32.43 
 
 		 74 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>