11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2955 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2955  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  135  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3943  hypothetical protein  55.88 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.135626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2185  hypothetical protein  55 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.753765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  36.36 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  32.26 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  30.77 
 
 		 75 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  32.14 
 
 		 74 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  30.36 
 
 		 75 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  33.85 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  35.9 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  27.94 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>