37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1412 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  100 
 
 		 86 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  58.9 
 
 		 74 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  49.32 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 		 74 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  52.78 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  52.78 
 
 		 91 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  55.56 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  53.42 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  52.05 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  47.22 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  44.59 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  47.3 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  44.44 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.57 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.06 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.14 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  45.83 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.57 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.3 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.57 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  44.44 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4123  hypothetical protein  48.57 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.14 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4296  hypothetical protein  47.14 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.28 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3137  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.28 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.408099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.57 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.25 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.14 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2153  SpoVT/AbrB domain protein  47.14 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3452  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.86 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.67 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4109  SpoVT/AbrB-like  36 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.462334  normal  0.998914 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0559  AbrB family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0558  AbrB family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2955  hypothetical protein  32.26 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3943  hypothetical protein  33.87 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.135626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>