31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2972 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3137  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 
73 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.408099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 
73 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  49.32 
 
 
73 aa  84.3  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.21 
 
 
73 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.21 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  43.84 
 
 
73 aa  77  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  43.84 
 
 
73 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.95 
 
 
74 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.1 
 
 
73 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  40.85 
 
 
74 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.54 
 
 
74 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  39.73 
 
 
73 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  36.99 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  38.03 
 
 
74 aa  62  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  40.28 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.44 
 
 
74 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  36.11 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  28.17 
 
 
74 aa  58.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44.74 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0567  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  74.29 
 
 
56 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  34.25 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  29.58 
 
 
74 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.78 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  32.43 
 
 
91 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.25 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  29.73 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  28.17 
 
 
74 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  32.43 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0559  AbrB family transcriptional regulator  44.74 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0558  AbrB family transcriptional regulator  44.74 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  28.77 
 
 
73 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>