32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1314 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1314  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 
73 aa  150  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271247  normal  0.35065 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0781  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  91.78 
 
 
73 aa  143  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1371  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  83.56 
 
 
73 aa  134  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2175  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  83.56 
 
 
73 aa  133  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.634416  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2110  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  79.45 
 
 
73 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2467  SpoVT/AbrB domain-containing protein  56.52 
 
 
74 aa  92.8  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0218  putative addiction module antidote  62.69 
 
 
74 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108167 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8344  addiction module antidote  60.87 
 
 
74 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1578  addiction module antidote  59.42 
 
 
74 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23904 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2222  putative addiction module antidote  53.62 
 
 
74 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.286313  hitchhiker  0.00864042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1983  addiction module antidote  49.32 
 
 
74 aa  84.7  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3405  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50.72 
 
 
74 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226786  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4595  addiction module antidote  52.05 
 
 
73 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00566686  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3137  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.21 
 
 
73 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.408099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.21 
 
 
73 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2982  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 
74 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.354218  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4245  addiction module antidote  52.86 
 
 
75 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4393  addiction module antidote  50 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.706573 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02087  putative addiction module antidote  45.21 
 
 
73 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6861  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  48.65 
 
 
74 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387116  normal  0.292975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1258  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  49.32 
 
 
73 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1412  SpoVT/AbrB-like  47.14 
 
 
86 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0288311  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1432  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  40.54 
 
 
91 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0034  hypothetical protein  48.57 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0853  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.47 
 
 
73 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3972  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.19 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157013  normal  0.120349 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00220  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  33.78 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2705  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.11 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4109  SpoVT/AbrB-like  33.33 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.462334  normal  0.998914 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2153  SpoVT/AbrB domain protein  37.31 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.84509  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0558  AbrB family transcriptional regulator  43.42 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0559  AbrB family transcriptional regulator  43.42 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>