41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2177 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2177  protein of unknown function DUF465  100 
 
 		 67 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2878  hypothetical protein  70.15 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.427605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2006  hypothetical protein  68.66 
 
 		 67 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.260098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  59.02 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  54.84 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1341  hypothetical protein  64.18 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1594  hypothetical protein  61.19 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.0150012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1922  hypothetical protein  61.19 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.724919  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1234  hypothetical protein  61.19 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.104274  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  53.57 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  51.79 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1862  hypothetical protein  64.06 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.840373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1625  hypothetical protein  59.7 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2618  hypothetical protein  71.64 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0363565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  50.88 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  46.77 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  46.77 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0223  hypothetical protein  51.02 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.914287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  45.16 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6218  hypothetical protein  51.02 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  45.16 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  49.09 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2203  hypothetical protein  55.1 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  49.09 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  47.17 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03604  hypothetical protein  52.63 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.344235  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  51.92 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  45.16 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  48.21 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  51.92 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  45.16 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  49.09 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3053  hypothetical protein  51.02 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0057  hypothetical protein  49.12 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  48.98 
 
 		 68 aa  43.9  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3681  hypothetical protein  42.37 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145349  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  48.98 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0908  hypothetical protein  47.37 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0526127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0611  hypothetical protein  42.62 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3410  hypothetical protein  44.9 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>