41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3958 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  95.59 
 
 		 68 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  95.59 
 
 		 68 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  94.12 
 
 		 68 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  91.18 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  89.71 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  69.12 
 
 		 72 aa  86.7  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  61.76 
 
 		 68 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  69.7 
 
 		 72 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  68.97 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  69.49 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  69.49 
 
 		 72 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  69.49 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  67.86 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  67.86 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  63.49 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3572  protein of unknown function DUF465  50 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3273  protein of unknown function DUF465  50 
 
 		 67 aa  66.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  60 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3681  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145349  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0235  protein of unknown function DUF465  49.23 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743384  normal  0.169957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0611  hypothetical protein  52.94 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3410  hypothetical protein  48.53 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0908  hypothetical protein  49.32 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0526127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2203  hypothetical protein  58.62 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  58.49 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6844  hypothetical protein  96.67 
 
 		 30 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3053  hypothetical protein  58.93 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0223  hypothetical protein  57.14 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.914287 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6218  hypothetical protein  55.36 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2671  hypothetical protein  54.41 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166335  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2080  hypothetical protein  58.82 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000147635  hitchhiker  0.0000000000000428193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2569  hypothetical protein  42.19 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  55.36 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0082  hypothetical protein  58.82 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1683  hypothetical protein  47.06 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1743  hypothetical protein  47.06 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  51.79 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1170  hypothetical protein  45.59 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2006  hypothetical protein  48.08 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.260098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>