40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1003 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  207  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  85.56 
 
 
91 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  89.71 
 
 
68 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  86.76 
 
 
68 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  86.76 
 
 
68 aa  116  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  88.24 
 
 
68 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  61.25 
 
 
86 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  66.18 
 
 
72 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  61.76 
 
 
68 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  73.21 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  71.19 
 
 
73 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  71.19 
 
 
72 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  73.21 
 
 
72 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  71.19 
 
 
73 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  61.76 
 
 
72 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3572  protein of unknown function DUF465  57.35 
 
 
67 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3273  protein of unknown function DUF465  57.35 
 
 
67 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  63.33 
 
 
74 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  60 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3681  hypothetical protein  51.47 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3410  hypothetical protein  51.47 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0235  protein of unknown function DUF465  49.23 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743384  normal  0.169957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2203  hypothetical protein  60.34 
 
 
72 aa  62.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0908  hypothetical protein  50.75 
 
 
73 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0526127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  60.38 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0611  hypothetical protein  51.47 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348619  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2671  hypothetical protein  55.88 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166335  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3053  hypothetical protein  60.38 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0223  hypothetical protein  58.49 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.914287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6844  hypothetical protein  90 
 
 
30 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6218  hypothetical protein  56.6 
 
 
72 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2080  hypothetical protein  57.35 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000147635  hitchhiker  0.0000000000000428193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2569  hypothetical protein  49.06 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  42.86 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1683  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1743  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  55.36 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1170  hypothetical protein  48.53 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0082  hypothetical protein  57.35 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>