42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1048 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  134  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  52.94 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2203  hypothetical protein  62.71 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6218  hypothetical protein  59.68 
 
 		 72 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0223  hypothetical protein  58.06 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.914287 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  56.67 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  50 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  55 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3053  hypothetical protein  54.84 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  53.03 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0235  protein of unknown function DUF465  55 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743384  normal  0.169957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  48.53 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  48.53 
 
 		 68 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0611  hypothetical protein  51.61 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  53.12 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  51.72 
 
 		 72 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  51.72 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  51.72 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  48.53 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  57.14 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  52.46 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0908  hypothetical protein  52.46 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0526127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  57.14 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3572  protein of unknown function DUF465  45.59 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3681  hypothetical protein  44.12 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145349  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3273  protein of unknown function DUF465  44.12 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1608  hypothetical protein  61.29 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  49.12 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3410  hypothetical protein  44.12 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2006  hypothetical protein  48.44 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.260098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2569  hypothetical protein  45 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03604  hypothetical protein  51.85 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.344235  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2878  hypothetical protein  49.15 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.427605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3507  protein of unknown function DUF465  62.9 
 
 		 66 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.364239  normal  0.427533 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0057  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0082  hypothetical protein  55 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1124  hypothetical protein  53.12 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000780596  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2177  protein of unknown function DUF465  54.84 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>