42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2597 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  131  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  61.76 
 
 
68 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  61.76 
 
 
107 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  60.29 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  61.76 
 
 
68 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  61.76 
 
 
68 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  65.67 
 
 
72 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  73.21 
 
 
75 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  58.82 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  64.18 
 
 
72 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3681  hypothetical protein  55.88 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  69.64 
 
 
72 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3410  hypothetical protein  52.94 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3273  protein of unknown function DUF465  50 
 
 
67 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  63.93 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3572  protein of unknown function DUF465  50 
 
 
67 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  60 
 
 
74 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  61.67 
 
 
72 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  64.29 
 
 
73 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  64.29 
 
 
73 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  64.29 
 
 
72 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0611  hypothetical protein  58.33 
 
 
74 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348619  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3053  hypothetical protein  63.33 
 
 
72 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0223  hypothetical protein  61.67 
 
 
72 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.914287 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6218  hypothetical protein  60 
 
 
72 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2203  hypothetical protein  62.71 
 
 
72 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  60.38 
 
 
65 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  55 
 
 
68 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2080  hypothetical protein  60.29 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000147635  hitchhiker  0.0000000000000428193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0908  hypothetical protein  56.45 
 
 
73 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0526127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2671  hypothetical protein  51.47 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166335  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_004310  BR1743  hypothetical protein  51.47 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115959  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1683  hypothetical protein  51.47 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0235  protein of unknown function DUF465  46.15 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743384  normal  0.169957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1170  hypothetical protein  48.53 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2569  hypothetical protein  46.88 
 
 
70 aa  52  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  48.44 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0082  hypothetical protein  60.32 
 
 
65 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  53.33 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0057  hypothetical protein  51.85 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6844  hypothetical protein  66.67 
 
 
30 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03604  hypothetical protein  48 
 
 
67 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.344235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>