25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03604 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03604  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  131  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.344235  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0057  hypothetical protein  61.19 
 
 
67 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  52.46 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  51.85 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  57.69 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  50 
 
 
71 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  42.62 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2569  hypothetical protein  43.75 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0223  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.914287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  42.62 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  42.62 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0235  protein of unknown function DUF465  45.9 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743384  normal  0.169957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2203  hypothetical protein  54 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6218  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  40.68 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3053  hypothetical protein  48 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3681  hypothetical protein  43.4 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145349  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  47.46 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2878  hypothetical protein  47.37 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.427605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3410  hypothetical protein  41.38 
 
 
69 aa  40.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  47.17 
 
 
75 aa  40.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3572  protein of unknown function DUF465  41.38 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  47.17 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  48 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  48 
 
 
68 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>