46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0634 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  124  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  59.68 
 
 		 74 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  64.15 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  64.15 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0908  hypothetical protein  55.74 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0526127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  64.15 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2569  hypothetical protein  50.77 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  60.38 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  60.38 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  60.38 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  54.84 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  62.26 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3053  hypothetical protein  57.89 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6218  hypothetical protein  56.14 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  57.14 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  58.49 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  60.38 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  60.38 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0223  hypothetical protein  56.14 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.914287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  58.49 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  58.49 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  60.38 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2203  hypothetical protein  53.03 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  60.38 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  53.85 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0611  hypothetical protein  46.88 
 
 		 74 aa  57  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3410  hypothetical protein  54.72 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0082  hypothetical protein  60 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3572  protein of unknown function DUF465  56.6 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  49.12 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3681  hypothetical protein  56.6 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145349  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3273  protein of unknown function DUF465  56.6 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2028  hypothetical protein  42.59 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  48.33 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0235  protein of unknown function DUF465  43.33 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743384  normal  0.169957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2080  hypothetical protein  46.88 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000147635  hitchhiker  0.0000000000000428193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0726  hypothetical protein  60 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3272  protein of unknown function DUF465  43.75 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0490  hypothetical protein  41.18 
 
 		 54 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1608  hypothetical protein  48.44 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2006  hypothetical protein  44.44 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.260098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3571  protein of unknown function DUF465  43.75 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0658727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1941  protein of unknown function DUF465  42 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3409  hypothetical protein  43.48 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03604  hypothetical protein  47.46 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.344235  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2571  hypothetical protein  44 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>