29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3272 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3272  protein of unknown function DUF465  100 
 
 		 57 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3571  protein of unknown function DUF465  91.23 
 
 		 57 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0658727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2670  hypothetical protein  63.16 
 
 		 57 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169665  normal  0.21377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1450  hypothetical protein  54.72 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3680  hypothetical protein  63.16 
 
 		 57 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3409  hypothetical protein  50.94 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2079  protein of unknown function DUF465  49.09 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2690  hypothetical protein  49.09 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.75863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1004  hypothetical protein  59.65 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.156791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4651  hypothetical protein  49.09 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1682  hypothetical protein  46.43 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1239  hypothetical protein  54.72 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111273  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1741  hypothetical protein  46.43 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.339434  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1171  hypothetical protein  42.86 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1066  hypothetical protein  49.09 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1427  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.211415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1914  protein of unknown function DUF465  50 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3957  hypothetical protein  48.21 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1959  hypothetical protein  48.21 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2235  protein of unknown function DUF465  48.21 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.878546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1941  protein of unknown function DUF465  40.74 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2598  hypothetical protein  38.18 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2082  hypothetical protein  41.82 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334983  hitchhiker  0.000000000000216379 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2028  hypothetical protein  40.38 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0443  hypothetical protein  44.44 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.427552  normal  0.0699724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  43.75 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6254  hypothetical protein  39.29 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.376147  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4054  hypothetical protein  39.29 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3231  hypothetical protein  39.29 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>