31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1066 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1066  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2079  protein of unknown function DUF465  70.91 
 
 
61 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2690  hypothetical protein  70.91 
 
 
61 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.75863 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1450  hypothetical protein  56.67 
 
 
60 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2235  protein of unknown function DUF465  65 
 
 
58 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.878546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1959  hypothetical protein  65 
 
 
58 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1914  protein of unknown function DUF465  62.5 
 
 
58 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1427  hypothetical protein  53.33 
 
 
60 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.211415  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1171  hypothetical protein  55.56 
 
 
60 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3957  hypothetical protein  53.33 
 
 
60 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275498  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1682  hypothetical protein  53.7 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1741  hypothetical protein  53.7 
 
 
59 aa  61.6  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.339434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2082  hypothetical protein  50 
 
 
59 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334983  hitchhiker  0.000000000000216379 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1004  hypothetical protein  52.46 
 
 
61 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.156791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4651  hypothetical protein  48.33 
 
 
60 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2598  hypothetical protein  46.67 
 
 
59 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3409  hypothetical protein  54.72 
 
 
59 aa  58.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1941  protein of unknown function DUF465  50 
 
 
62 aa  58.9  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0443  hypothetical protein  58.18 
 
 
61 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.427552  normal  0.0699724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1239  hypothetical protein  52.46 
 
 
61 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111273  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2670  hypothetical protein  48.21 
 
 
57 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169665  normal  0.21377 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3739  hypothetical protein  50 
 
 
55 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3272  protein of unknown function DUF465  49.09 
 
 
57 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3571  protein of unknown function DUF465  45.45 
 
 
57 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0658727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2028  hypothetical protein  44.23 
 
 
72 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0911  hypothetical protein  42.59 
 
 
57 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.645235  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3231  hypothetical protein  42.11 
 
 
71 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3069  protein of unknown function DUF465  42.59 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4054  hypothetical protein  42.59 
 
 
57 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6254  hypothetical protein  42.59 
 
 
57 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.376147  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0081  hypothetical protein  39.58 
 
 
52 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>