29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3739 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3739  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3069  protein of unknown function DUF465  57.69 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0490  hypothetical protein  59.62 
 
 		 54 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2028  hypothetical protein  52.83 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1171  hypothetical protein  53.85 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1066  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1741  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.339434  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1682  hypothetical protein  50 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6254  hypothetical protein  38.18 
 
 		 57 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.376147  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4054  hypothetical protein  38.18 
 
 		 57 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1914  protein of unknown function DUF465  53.85 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1959  hypothetical protein  53.85 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2235  protein of unknown function DUF465  53.85 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.878546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3409  hypothetical protein  45.45 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2082  hypothetical protein  43.64 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334983  hitchhiker  0.000000000000216379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2079  protein of unknown function DUF465  50 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2690  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.75863 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3231  hypothetical protein  40.38 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1941  protein of unknown function DUF465  46.15 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2403  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.973793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2468  hypothetical protein  52.83 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.528801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2670  hypothetical protein  46.15 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169665  normal  0.21377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1239  hypothetical protein  42.31 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111273  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0911  hypothetical protein  38.46 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.645235  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3571  protein of unknown function DUF465  42.31 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0658727 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0443  hypothetical protein  44.23 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.427552  normal  0.0699724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1607  hypothetical protein  42.31 
 
 		 55 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1004  hypothetical protein  44.23 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.156791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1450  hypothetical protein  40 
 
 		 60 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>