27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0490 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0490  hypothetical protein  100 
 
 
54 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2028  hypothetical protein  59.62 
 
 
72 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3069  protein of unknown function DUF465  57.69 
 
 
55 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3739  hypothetical protein  59.62 
 
 
55 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0911  hypothetical protein  44.9 
 
 
57 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.645235  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2082  hypothetical protein  42.59 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334983  hitchhiker  0.000000000000216379 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4054  hypothetical protein  44.23 
 
 
57 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6254  hypothetical protein  44.23 
 
 
57 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.376147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2403  hypothetical protein  58.49 
 
 
61 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.973793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3409  hypothetical protein  40.38 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3508  protein of unknown function DUF465  44.23 
 
 
56 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.260732  normal  0.425001 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2468  hypothetical protein  54.72 
 
 
62 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.528801  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1607  hypothetical protein  46.3 
 
 
55 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1682  hypothetical protein  42.59 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  41.18 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3571  protein of unknown function DUF465  42.59 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0658727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2598  hypothetical protein  33.33 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1741  hypothetical protein  42.59 
 
 
59 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.339434  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3231  hypothetical protein  40.38 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2571  hypothetical protein  42.86 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2690  hypothetical protein  42.31 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.75863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2079  protein of unknown function DUF465  42.31 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2670  hypothetical protein  40.74 
 
 
57 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169665  normal  0.21377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1941  protein of unknown function DUF465  44.23 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1171  hypothetical protein  40.74 
 
 
60 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0443  hypothetical protein  42.31 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.427552  normal  0.0699724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1004  hypothetical protein  40.38 
 
 
61 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.156791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>