41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2028 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2028  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  147  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3069  protein of unknown function DUF465  67.31 
 
 		 55 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0490  hypothetical protein  59.62 
 
 		 54 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6254  hypothetical protein  59.62 
 
 		 57 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.376147  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4054  hypothetical protein  59.62 
 
 		 57 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3231  hypothetical protein  52.38 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2082  hypothetical protein  52.83 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334983  hitchhiker  0.000000000000216379 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3739  hypothetical protein  52.83 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2690  hypothetical protein  48.08 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.75863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2079  protein of unknown function DUF465  48.08 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2403  hypothetical protein  62.26 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.973793 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1682  hypothetical protein  43.55 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1239  hypothetical protein  48.08 
 
 		 61 aa  50.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111273  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2468  hypothetical protein  60.38 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.528801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1004  hypothetical protein  48.08 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.156791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1450  hypothetical protein  46.15 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1741  hypothetical protein  48.08 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.339434  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3409  hypothetical protein  48.08 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1066  hypothetical protein  44.23 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  42.59 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2598  hypothetical protein  41.82 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1171  hypothetical protein  44.23 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4651  hypothetical protein  40.38 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1914  protein of unknown function DUF465  44.23 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1959  hypothetical protein  44.23 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1427  hypothetical protein  44.23 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.211415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2235  protein of unknown function DUF465  44.23 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.878546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1941  protein of unknown function DUF465  40.38 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3272  protein of unknown function DUF465  40.38 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3571  protein of unknown function DUF465  40.38 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0658727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0908  hypothetical protein  42.86 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0526127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2571  hypothetical protein  40.38 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  42 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2670  hypothetical protein  40.38 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169665  normal  0.21377 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3508  protein of unknown function DUF465  42.59 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.260732  normal  0.425001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3957  hypothetical protein  40.38 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0443  hypothetical protein  40.38 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.427552  normal  0.0699724 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0235  protein of unknown function DUF465  40 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743384  normal  0.169957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0911  hypothetical protein  38.78 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.645235  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0611  hypothetical protein  42.11 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  35.19 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>