30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1239 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1239  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111273  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1004  hypothetical protein  83.61 
 
 		 61 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.156791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1450  hypothetical protein  72.13 
 
 		 60 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3957  hypothetical protein  72.13 
 
 		 60 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1427  hypothetical protein  68.85 
 
 		 60 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.211415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4651  hypothetical protein  68.85 
 
 		 60 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2079  protein of unknown function DUF465  57.38 
 
 		 61 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2690  hypothetical protein  57.38 
 
 		 61 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.75863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1914  protein of unknown function DUF465  60.71 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2235  protein of unknown function DUF465  57.89 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.878546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1959  hypothetical protein  57.89 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2670  hypothetical protein  57.14 
 
 		 57 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169665  normal  0.21377 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1171  hypothetical protein  54.72 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1066  hypothetical protein  52.46 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3409  hypothetical protein  56.6 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1682  hypothetical protein  54.72 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1741  hypothetical protein  54.72 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.339434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2598  hypothetical protein  45.9 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2082  hypothetical protein  53.57 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334983  hitchhiker  0.000000000000216379 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0443  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.427552  normal  0.0699724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3069  protein of unknown function DUF465  49.09 
 
 		 55 aa  54.3  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3272  protein of unknown function DUF465  54.72 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3571  protein of unknown function DUF465  52.83 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0658727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2028  hypothetical protein  48.08 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1941  protein of unknown function DUF465  40.32 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2571  hypothetical protein  38.33 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3739  hypothetical protein  42.31 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3680  hypothetical protein  56.6 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4054  hypothetical protein  39.62 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6254  hypothetical protein  39.62 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.376147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>