31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3680 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3680  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2670  hypothetical protein  66.67 
 
 		 57 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169665  normal  0.21377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3272  protein of unknown function DUF465  63.16 
 
 		 57 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3571  protein of unknown function DUF465  59.65 
 
 		 57 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0658727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4651  hypothetical protein  55.36 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1004  hypothetical protein  60 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.156791 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1682  hypothetical protein  52.54 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1741  hypothetical protein  52.54 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.339434  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1450  hypothetical protein  54.55 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1171  hypothetical protein  49.15 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2079  protein of unknown function DUF465  49.09 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2690  hypothetical protein  49.09 
 
 		 61 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.75863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1914  protein of unknown function DUF465  52.73 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1427  hypothetical protein  52.73 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.211415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1959  hypothetical protein  53.7 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2235  protein of unknown function DUF465  53.7 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.878546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1239  hypothetical protein  56.6 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111273  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3957  hypothetical protein  49.09 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2082  hypothetical protein  46.43 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334983  hitchhiker  0.000000000000216379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3409  hypothetical protein  47.46 
 
 		 59 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1066  hypothetical protein  46.3 
 
 		 60 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2598  hypothetical protein  40 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2028  hypothetical protein  44.23 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3231  hypothetical protein  43.64 
 
 		 71 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3069  protein of unknown function DUF465  43.64 
 
 		 55 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4054  hypothetical protein  41.82 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6254  hypothetical protein  41.82 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.376147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0911  hypothetical protein  38.6 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.645235  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1607  hypothetical protein  40.74 
 
 		 55 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1941  protein of unknown function DUF465  35.19 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3739  hypothetical protein  44.23 
 
 		 55 aa  40  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>