25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4054 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_6254  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.376147  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4054  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3231  hypothetical protein  91.23 
 
 		 71 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2028  hypothetical protein  59.62 
 
 		 72 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3069  protein of unknown function DUF465  47.27 
 
 		 55 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2079  protein of unknown function DUF465  43.64 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3739  hypothetical protein  38.18 
 
 		 55 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2690  hypothetical protein  43.64 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663367  normal  0.75863 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1941  protein of unknown function DUF465  42.59 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0490  hypothetical protein  44.23 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1171  hypothetical protein  37.5 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1914  protein of unknown function DUF465  41.07 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_004310  BR1741  hypothetical protein  37.5 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.339434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1066  hypothetical protein  42.59 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1959  hypothetical protein  42.59 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2235  protein of unknown function DUF465  42.59 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.878546 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1682  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2082  hypothetical protein  43.64 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0334983  hitchhiker  0.000000000000216379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3272  protein of unknown function DUF465  39.29 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3409  hypothetical protein  43.4 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1004  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.156791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2670  hypothetical protein  35.71 
 
 		 57 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.169665  normal  0.21377 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1239  hypothetical protein  39.62 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111273  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  40.38 
 
 		 74 aa  40.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3571  protein of unknown function DUF465  35.71 
 
 		 57 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0658727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>