45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0908 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0908  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  137  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0526127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  54.79 
 
 
74 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3053  hypothetical protein  61.4 
 
 
72 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  55.74 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2203  hypothetical protein  59.65 
 
 
72 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0223  hypothetical protein  59.65 
 
 
72 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.914287 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  50.68 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  57.89 
 
 
72 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  50.68 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  52.05 
 
 
68 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  54.29 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6218  hypothetical protein  57.89 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  64.29 
 
 
72 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  66.07 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  49.32 
 
 
68 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  50.75 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  55.36 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  51.43 
 
 
72 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0611  hypothetical protein  55.36 
 
 
74 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348619  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  57.14 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  57.14 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  52.46 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  57.14 
 
 
73 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  52.17 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  56.45 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0235  protein of unknown function DUF465  47.69 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743384  normal  0.169957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  53.33 
 
 
72 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2569  hypothetical protein  56.6 
 
 
70 aa  53.9  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3681  hypothetical protein  50.88 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  53.23 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3572  protein of unknown function DUF465  48.21 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3273  protein of unknown function DUF465  43.28 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3410  hypothetical protein  46.97 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2080  hypothetical protein  51.67 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000147635  hitchhiker  0.0000000000000428193 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0082  hypothetical protein  58.33 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2028  hypothetical protein  42.86 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1608  hypothetical protein  55 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1478  hypothetical protein  45.61 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101478 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1796  hypothetical protein  43.86 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1820  hypothetical protein  43.86 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.668503  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6283  hypothetical protein  43.86 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0707127  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1734  hypothetical protein  43.86 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1707  hypothetical protein  43.86 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2062  hypothetical protein  39.06 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0443  hypothetical protein  43.64 
 
 
61 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.427552  normal  0.0699724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>