41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1449 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  97.06 
 
 		 68 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  95.59 
 
 		 68 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  95.59 
 
 		 68 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  88.24 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  86.76 
 
 		 107 aa  116  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  67.65 
 
 		 72 aa  87.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  63.24 
 
 		 72 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  66.67 
 
 		 86 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  71.19 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  71.19 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  71.19 
 
 		 72 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  71.43 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  71.43 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  58.82 
 
 		 68 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  68.33 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3572  protein of unknown function DUF465  50 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3273  protein of unknown function DUF465  50 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  58.73 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3681  hypothetical protein  51.47 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145349  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0611  hypothetical protein  54.69 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3410  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0908  hypothetical protein  50.68 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0526127 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0235  protein of unknown function DUF465  49.23 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743384  normal  0.169957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2203  hypothetical protein  60.34 
 
 		 72 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  48.53 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  60.38 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0223  hypothetical protein  58.93 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.914287 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3053  hypothetical protein  55.56 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6844  hypothetical protein  93.33 
 
 		 30 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6218  hypothetical protein  53.97 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2671  hypothetical protein  55.88 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166335  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2080  hypothetical protein  58.82 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000147635  hitchhiker  0.0000000000000428193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  50.7 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1683  hypothetical protein  48.53 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1743  hypothetical protein  48.53 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  51.79 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2569  hypothetical protein  40.62 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0082  hypothetical protein  58.73 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1170  hypothetical protein  47.06 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2006  hypothetical protein  48.08 
 
 		 67 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.260098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>