41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0442 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  136  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  76.39 
 
 		 72 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  76.79 
 
 		 72 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  62.5 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  75 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  63.24 
 
 		 68 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  69.7 
 
 		 68 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  61.76 
 
 		 68 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  61.76 
 
 		 68 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  61.76 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  59.72 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  59.72 
 
 		 73 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  64.18 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  59.72 
 
 		 73 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  61.76 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0611  hypothetical protein  63.33 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  63.33 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3410  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2203  hypothetical protein  63.79 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  60 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3273  protein of unknown function DUF465  44.12 
 
 		 67 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.847459 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0223  hypothetical protein  58.33 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.914287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  62.26 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3053  hypothetical protein  60 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6218  hypothetical protein  58.33 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0908  hypothetical protein  51.43 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0526127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3681  hypothetical protein  52.63 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145349  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3572  protein of unknown function DUF465  44.12 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  56.72 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  52.46 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2080  hypothetical protein  57.35 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000147635  hitchhiker  0.0000000000000428193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2569  hypothetical protein  44.26 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0082  hypothetical protein  64.29 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  46.88 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6844  hypothetical protein  76.67 
 
 		 30 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1683  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2671  hypothetical protein  44.12 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166335  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0235  protein of unknown function DUF465  44.64 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743384  normal  0.169957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2878  hypothetical protein  49.12 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.427605 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1170  hypothetical protein  42.65 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1743  hypothetical protein  41.18 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>