36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1366 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  100 
 
 
71 aa  137  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0223  hypothetical protein  59.7 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.914287 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6218  hypothetical protein  59.7 
 
 
72 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  59.02 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3053  hypothetical protein  59.7 
 
 
72 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  53.12 
 
 
68 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  56.72 
 
 
72 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  59.65 
 
 
74 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2878  hypothetical protein  55.38 
 
 
67 aa  57.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.427605 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2203  hypothetical protein  53.12 
 
 
72 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  56.67 
 
 
72 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0908  hypothetical protein  53.23 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0526127 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0235  protein of unknown function DUF465  43.84 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743384  normal  0.169957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  55.36 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  50.7 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2006  hypothetical protein  50.77 
 
 
67 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.260098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  55 
 
 
68 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0611  hypothetical protein  53.33 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348619  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  57.14 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  49.25 
 
 
72 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  55.36 
 
 
91 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  55.36 
 
 
68 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  57.14 
 
 
72 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  57.14 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  47.76 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  55.36 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  47.76 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  49.23 
 
 
72 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0057  hypothetical protein  55.17 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  53.33 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  48.33 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03604  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.344235  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1608  hypothetical protein  54.1 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2569  hypothetical protein  41.18 
 
 
70 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0082  hypothetical protein  58.33 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1124  hypothetical protein  57.81 
 
 
73 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000780596  normal  0.823957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>