30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1862 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1862  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.840373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2878  hypothetical protein  62.5 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.427605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2006  hypothetical protein  62.5 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.260098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  48.98 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2618  hypothetical protein  76.12 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0363565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  53.85 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  53.85 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  51.92 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  51.92 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2177  protein of unknown function DUF465  62.69 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  51.92 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  46.77 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  46.94 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  48.98 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  48.21 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  44.23 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  48.08 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  44 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  48.98 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  46.94 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  48.08 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  46.15 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  46.15 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  46.94 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  44.23 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03604  hypothetical protein  62.5 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.344235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0490  hypothetical protein  42.37 
 
 		 54 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3410  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3681  hypothetical protein  37.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>