23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2618 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2618  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  124  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0363565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2006  hypothetical protein  70.15 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.260098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2878  hypothetical protein  67.16 
 
 		 67 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.427605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1862  hypothetical protein  76.12 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.840373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2177  protein of unknown function DUF465  71.64 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  47.17 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  42.86 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  42.86 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  45.28 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  51.61 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  42.86 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  45.28 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  49.06 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  51.85 
 
 		 107 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  47.17 
 
 		 68 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  41.51 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1341  hypothetical protein  56.72 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  47.27 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  47.17 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  45.16 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  43.86 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  45.28 
 
 		 68 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>