40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1594 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1594  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.0150012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1922  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.724919  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1625  hypothetical protein  92.54 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1234  hypothetical protein  80.6 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.104274  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1341  hypothetical protein  83.58 
 
 		 67 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2006  hypothetical protein  55.22 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.260098 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2878  hypothetical protein  53.73 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.427605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  50 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  51.67 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  42.42 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2177  protein of unknown function DUF465  61.19 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.681475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  52.83 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  43.94 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  43.94 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03604  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.344235  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2078  protein of unknown function DUF465  54 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  43.94 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  47.76 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  42.42 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2691  hypothetical protein  54 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224545  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2236  protein of unknown function DUF465  54 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1940  protein of unknown function DUF465  40.91 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1960  hypothetical protein  54 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  50.94 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  42.42 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1915  protein of unknown function DUF465  52.83 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.366277 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2525  protein of unknown function DUF465  56.45 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120851  decreased coverage  0.000000000491665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1611  hypothetical protein  56.45 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0722628  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1404  hypothetical protein  54.84 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0377029  hitchhiker  0.000000270393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0223  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.914287 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0611  hypothetical protein  46.55 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0682  protein of unknown function DUF465  49.06 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3053  hypothetical protein  52 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1065  hypothetical protein  47.17 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3351  hypothetical protein  49.06 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6218  hypothetical protein  48 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0057  hypothetical protein  45 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982813 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0235  protein of unknown function DUF465  41.94 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743384  normal  0.169957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0442  hypothetical protein  48 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.299566  normal  0.1097 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2569  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>