42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2525 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2525  protein of unknown function DUF465  100 
 
 		 72 aa  140  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120851  decreased coverage  0.000000000491665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1611  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  140  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0722628  normal  0.404854 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1404  hypothetical protein  90.14 
 
 		 72 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0377029  hitchhiker  0.000000270393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0235  protein of unknown function DUF465  50 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.743384  normal  0.169957 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6283  hypothetical protein  47.76 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0707127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1820  hypothetical protein  47.76 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.668503  normal  0.377626 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1796  hypothetical protein  47.76 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5097  hypothetical protein  51.67 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1734  hypothetical protein  51.67 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1707  hypothetical protein  51.67 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1478  hypothetical protein  46.27 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2250  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234259  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1087  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0274543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2208  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2171  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0080  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.437644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1816  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1327  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2337  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1625  hypothetical protein  61.29 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1341  hypothetical protein  56.25 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1366  protein of unknown function DUF465  45.9 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.07122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1234  hypothetical protein  51.56 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.104274  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2006  hypothetical protein  43.86 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.260098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1922  hypothetical protein  56.45 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.724919  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1594  hypothetical protein  56.45 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60462  normal  0.0150012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3049  hypothetical protein  41.54 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1003  hypothetical protein  40.58 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.256308 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1048  hypothetical protein  42.37 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1238  hypothetical protein  43.4 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.851517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3958  hypothetical protein  43.4 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.276587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4652  protein of unknown function DUF465  43.4 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2878  hypothetical protein  34.38 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.427605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1426  hypothetical protein  43.4 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0634  hypothetical protein  37.1 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.817718  normal  0.243317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1449  hypothetical protein  41.51 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2569  hypothetical protein  39.34 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2597  hypothetical protein  45.61 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2203  hypothetical protein  37.68 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2571  hypothetical protein  45.45 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6254  hypothetical protein  39.29 
 
 		 57 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.376147  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4054  hypothetical protein  39.29 
 
 		 57 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0656342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>