59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0023 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0023  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  987    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885389  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1206  hypothetical protein  39.86 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0364566  normal  0.012597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0914  hypothetical protein  40.47 
 
 		 463 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3571  hypothetical protein  40.87 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00560802  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5487  hypothetical protein  40.87 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4796  hypothetical protein  40.87 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1650  hypothetical protein  38.73 
 
 		 480 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0235  hypothetical protein  37.33 
 
 		 459 aa  262  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0183  hypothetical protein  40.04 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190652  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5425  hypothetical protein  35.11 
 
 		 477 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4107  hypothetical protein  37.58 
 
 		 447 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0316  hypothetical protein  38.44 
 
 		 469 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3894  hypothetical protein  34.91 
 
 		 454 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0570  hypothetical protein  36.36 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370809  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06624  hypothetical protein  34.4 
 
 		 446 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06080  hypothetical protein  35.84 
 
 		 452 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0183043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0634  hypothetical protein  31.01 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.979401  normal  0.927861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4869  hypothetical protein  35.36 
 
 		 442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286594  normal  0.361614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3179  hypothetical protein  35.16 
 
 		 449 aa  219  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3845  hypothetical protein  34.84 
 
 		 485 aa  209  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.416585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5000  hypothetical protein  32.43 
 
 		 449 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4948  hypothetical protein  32.22 
 
 		 449 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4841  hypothetical protein  32.01 
 
 		 449 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4914  hypothetical protein  32.22 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4636  hypothetical protein  33.56 
 
 		 450 aa  206  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5915  hypothetical protein  33.56 
 
 		 450 aa  206  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.409542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0421  hypothetical protein  30.26 
 
 		 451 aa  206  8e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0561  hypothetical protein  32.62 
 
 		 455 aa  206  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4951  hypothetical protein  33.56 
 
 		 450 aa  205  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.90486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3656  hypothetical protein  33.56 
 
 		 450 aa  203  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.113964  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3597  Inner membrane CreD family protein  32.95 
 
 		 450 aa  203  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.156767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04276  tolerance to colicin E2  32.95 
 
 		 450 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04241  hypothetical protein  32.95 
 
 		 450 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4999  hypothetical protein  32.95 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0359  hypothetical protein  35.8 
 
 		 442 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117448  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4948  hypothetical protein  32.49 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2582  hypothetical protein  27.96 
 
 		 460 aa  196  7e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0877  hypothetical protein  35.13 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.663462  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0880  hypothetical protein  35.13 
 
 		 485 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1726  Inner membrane CreD family protein  26.22 
 
 		 453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2654  hypothetical protein  29.63 
 
 		 449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0362  hypothetical protein  34.31 
 
 		 442 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5193  hypothetical protein  33.63 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135517  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1175  hypothetical protein  28.93 
 
 		 469 aa  164  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1315  hypothetical protein  32.26 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4334  hypothetical protein  29.61 
 
 		 453 aa  159  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0370  hypothetical protein  29.4 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3656  hypothetical protein  29.18 
 
 		 490 aa  158  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0365  hypothetical protein  29.09 
 
 		 491 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3605  hypothetical protein  28.57 
 
 		 494 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3274  hypothetical protein  31.02 
 
 		 479 aa  150  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0138  hypothetical protein  24.6 
 
 		 449 aa  149  9e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.986038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3919  hypothetical protein  29.93 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3996  hypothetical protein  29.93 
 
 		 492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4112  hypothetical protein  29.09 
 
 		 492 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4019  hypothetical protein  29.09 
 
 		 492 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0303  hypothetical protein  30.04 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0463  hypothetical protein  27.89 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4153  hypothetical protein  27.23 
 
 		 450 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>