59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4636 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3597  Inner membrane CreD family protein  97.56 
 
 
450 aa  855    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.156767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04276  tolerance to colicin E2  99.11 
 
 
450 aa  906    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4636  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  914    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179844  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4999  hypothetical protein  98.67 
 
 
450 aa  901    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3656  hypothetical protein  98.44 
 
 
450 aa  901    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.113964  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4951  hypothetical protein  99.11 
 
 
450 aa  906    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.90486  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4948  hypothetical protein  98.44 
 
 
450 aa  901    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4948  hypothetical protein  73.78 
 
 
449 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5000  hypothetical protein  73.78 
 
 
449 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4841  hypothetical protein  74.22 
 
 
449 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04241  hypothetical protein  99.11 
 
 
450 aa  906    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4914  hypothetical protein  73.56 
 
 
449 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5915  hypothetical protein  98.89 
 
 
450 aa  904    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.409542  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0561  hypothetical protein  63.3 
 
 
455 aa  585  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3894  hypothetical protein  44.44 
 
 
454 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708894  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3845  hypothetical protein  47.43 
 
 
485 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.416585 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0880  hypothetical protein  47.43 
 
 
485 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0877  hypothetical protein  47.43 
 
 
485 aa  335  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.663462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0235  hypothetical protein  36.47 
 
 
459 aa  265  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4107  hypothetical protein  40.68 
 
 
447 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06080  hypothetical protein  38.66 
 
 
452 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0183043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5193  hypothetical protein  39.44 
 
 
456 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135517  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4869  hypothetical protein  36.86 
 
 
442 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286594  normal  0.361614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0570  hypothetical protein  38.66 
 
 
452 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370809  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06624  hypothetical protein  33.19 
 
 
446 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0316  hypothetical protein  35.25 
 
 
469 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5425  hypothetical protein  33.56 
 
 
477 aa  236  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1206  hypothetical protein  36.69 
 
 
439 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0364566  normal  0.012597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3571  hypothetical protein  35.23 
 
 
462 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00560802  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5487  hypothetical protein  35.23 
 
 
462 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4796  hypothetical protein  35.23 
 
 
462 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0634  hypothetical protein  30.63 
 
 
453 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.979401  normal  0.927861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0362  hypothetical protein  37.62 
 
 
442 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1650  hypothetical protein  32.89 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966752  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0359  hypothetical protein  37.13 
 
 
442 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117448  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0183  hypothetical protein  34.94 
 
 
466 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190652  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0914  hypothetical protein  34.62 
 
 
463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0421  hypothetical protein  31.54 
 
 
451 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2654  hypothetical protein  33.03 
 
 
449 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3179  hypothetical protein  34.38 
 
 
449 aa  196  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1726  Inner membrane CreD family protein  28.07 
 
 
453 aa  194  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2582  hypothetical protein  29.53 
 
 
460 aa  188  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1315  hypothetical protein  32.96 
 
 
471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0023  hypothetical protein  32.67 
 
 
493 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4153  hypothetical protein  31.76 
 
 
450 aa  183  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3605  hypothetical protein  32.95 
 
 
494 aa  178  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0365  hypothetical protein  32.72 
 
 
491 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0370  hypothetical protein  32.42 
 
 
490 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3656  hypothetical protein  32.42 
 
 
490 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4334  hypothetical protein  32.73 
 
 
453 aa  176  7e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0463  hypothetical protein  31.77 
 
 
448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0138  hypothetical protein  26.86 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.986038  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1175  hypothetical protein  28.7 
 
 
469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3996  hypothetical protein  31.22 
 
 
492 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4112  hypothetical protein  31.22 
 
 
492 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3919  hypothetical protein  31 
 
 
492 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4019  hypothetical protein  31 
 
 
492 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0303  hypothetical protein  30.59 
 
 
450 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3274  hypothetical protein  31.83 
 
 
479 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>