59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4107 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4107  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  899    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06080  hypothetical protein  66.52 
 
 		 452 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0183043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0570  hypothetical protein  66.29 
 
 		 452 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5193  hypothetical protein  66.52 
 
 		 456 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135517  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4869  hypothetical protein  64.41 
 
 		 442 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286594  normal  0.361614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0359  hypothetical protein  63.74 
 
 		 442 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117448  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0362  hypothetical protein  64.41 
 
 		 442 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200217 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3894  hypothetical protein  43.27 
 
 		 454 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0634  hypothetical protein  37.67 
 
 		 453 aa  325  7e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.979401  normal  0.927861 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06624  hypothetical protein  41.24 
 
 		 446 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1650  hypothetical protein  41.06 
 
 		 480 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0914  hypothetical protein  42.92 
 
 		 463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4796  hypothetical protein  43.27 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5487  hypothetical protein  43.27 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3571  hypothetical protein  43.27 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00560802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0561  hypothetical protein  39.86 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4841  hypothetical protein  41.14 
 
 		 449 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4636  hypothetical protein  40.68 
 
 		 450 aa  292  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4951  hypothetical protein  40.68 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.90486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0183  hypothetical protein  42.61 
 
 		 466 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5000  hypothetical protein  40.68 
 
 		 449 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4948  hypothetical protein  40.68 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3656  hypothetical protein  40.78 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.113964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5915  hypothetical protein  40.44 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.409542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04241  hypothetical protein  40.62 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4999  hypothetical protein  40.62 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04276  tolerance to colicin E2  40.62 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4914  hypothetical protein  40.45 
 
 		 449 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1206  hypothetical protein  39.72 
 
 		 439 aa  286  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0364566  normal  0.012597 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3597  Inner membrane CreD family protein  40.48 
 
 		 450 aa  286  7e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.156767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4948  hypothetical protein  40.38 
 
 		 450 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3179  hypothetical protein  40.98 
 
 		 449 aa  283  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5425  hypothetical protein  38.55 
 
 		 477 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3845  hypothetical protein  41.61 
 
 		 485 aa  269  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.416585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0235  hypothetical protein  37.47 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0421  hypothetical protein  36.36 
 
 		 451 aa  266  8e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0316  hypothetical protein  38.46 
 
 		 469 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0880  hypothetical protein  41.84 
 
 		 485 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0877  hypothetical protein  41.61 
 
 		 485 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.663462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0023  hypothetical protein  37.45 
 
 		 493 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885389  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2582  hypothetical protein  30.38 
 
 		 460 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1315  hypothetical protein  37.78 
 
 		 471 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2654  hypothetical protein  35.8 
 
 		 449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1726  Inner membrane CreD family protein  31.37 
 
 		 453 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0303  hypothetical protein  36.26 
 
 		 450 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0138  hypothetical protein  30.61 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.986038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3656  hypothetical protein  33.26 
 
 		 490 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0370  hypothetical protein  33.26 
 
 		 490 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3605  hypothetical protein  33.57 
 
 		 494 aa  209  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3274  hypothetical protein  36.04 
 
 		 479 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4334  hypothetical protein  33.71 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0365  hypothetical protein  33.33 
 
 		 491 aa  207  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4153  hypothetical protein  33.48 
 
 		 450 aa  207  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4019  hypothetical protein  32.72 
 
 		 492 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4112  hypothetical protein  32.72 
 
 		 492 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3996  hypothetical protein  32.72 
 
 		 492 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3919  hypothetical protein  32.49 
 
 		 492 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0463  hypothetical protein  35.09 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1175  hypothetical protein  28.09 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>