59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3919 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3919  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  998    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4334  hypothetical protein  87 
 
 
453 aa  763    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4112  hypothetical protein  99.19 
 
 
492 aa  991    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3996  hypothetical protein  98.78 
 
 
492 aa  987    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3605  hypothetical protein  88.26 
 
 
494 aa  853    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4019  hypothetical protein  98.78 
 
 
492 aa  988    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0370  hypothetical protein  86.76 
 
 
490 aa  834    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3656  hypothetical protein  86.97 
 
 
490 aa  836    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0365  hypothetical protein  85.4 
 
 
491 aa  825    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4153  hypothetical protein  63.68 
 
 
450 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0463  hypothetical protein  62.02 
 
 
448 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0303  hypothetical protein  58.26 
 
 
450 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3274  hypothetical protein  52.63 
 
 
479 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2582  hypothetical protein  31.1 
 
 
460 aa  219  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0421  hypothetical protein  33.33 
 
 
451 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3894  hypothetical protein  31.91 
 
 
454 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708894  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1650  hypothetical protein  32.87 
 
 
480 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966752  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06080  hypothetical protein  37.14 
 
 
452 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0183043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0634  hypothetical protein  32.21 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.979401  normal  0.927861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0570  hypothetical protein  36.98 
 
 
452 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370809  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4869  hypothetical protein  34.28 
 
 
442 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286594  normal  0.361614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5425  hypothetical protein  31.3 
 
 
477 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0914  hypothetical protein  32.65 
 
 
463 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2654  hypothetical protein  30.98 
 
 
449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0138  hypothetical protein  30.5 
 
 
449 aa  191  4e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.986038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4107  hypothetical protein  33.66 
 
 
447 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5487  hypothetical protein  33.03 
 
 
462 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.309763 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3571  hypothetical protein  33.03 
 
 
462 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00560802  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4796  hypothetical protein  33.03 
 
 
462 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0561  hypothetical protein  29.13 
 
 
455 aa  187  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5193  hypothetical protein  36.06 
 
 
456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135517  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06624  hypothetical protein  30.99 
 
 
446 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3845  hypothetical protein  31.9 
 
 
485 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.416585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0359  hypothetical protein  34.88 
 
 
442 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117448  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0183  hypothetical protein  33.03 
 
 
466 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.190652  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1315  hypothetical protein  33.03 
 
 
471 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3179  hypothetical protein  32.04 
 
 
449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1206  hypothetical protein  33.01 
 
 
439 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0364566  normal  0.012597 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04276  tolerance to colicin E2  31.07 
 
 
450 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4999  hypothetical protein  31.07 
 
 
450 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4636  hypothetical protein  31.31 
 
 
450 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04241  hypothetical protein  31.07 
 
 
450 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3656  hypothetical protein  31.55 
 
 
450 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.113964  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5915  hypothetical protein  31.07 
 
 
450 aa  177  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.409542  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4951  hypothetical protein  31.55 
 
 
450 aa  177  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.90486  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0362  hypothetical protein  36.06 
 
 
442 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.200217 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4948  hypothetical protein  30.83 
 
 
450 aa  176  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5000  hypothetical protein  29.82 
 
 
449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4948  hypothetical protein  29.82 
 
 
449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4914  hypothetical protein  29.82 
 
 
449 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4841  hypothetical protein  29.82 
 
 
449 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3597  Inner membrane CreD family protein  30.56 
 
 
450 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.156767  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0880  hypothetical protein  32.43 
 
 
485 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0877  hypothetical protein  32.43 
 
 
485 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.663462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0235  hypothetical protein  30.32 
 
 
459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1175  hypothetical protein  32.49 
 
 
469 aa  162  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1726  Inner membrane CreD family protein  26.88 
 
 
453 aa  157  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0316  hypothetical protein  30.73 
 
 
469 aa  154  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0023  hypothetical protein  30.84 
 
 
493 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.885389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>