More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00755 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  100 
 
 		 126 aa  216  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00755  ribosomal protein L17  100 
 
 		 107 aa  215  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  99 
 
 		 128 aa  202  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  89.72 
 
 		 126 aa  197  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  89.32 
 
 		 130 aa  193  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  89.32 
 
 		 130 aa  193  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  88.68 
 
 		 127 aa  193  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  88.68 
 
 		 127 aa  193  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  88.68 
 
 		 127 aa  193  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  88.68 
 
 		 127 aa  193  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  88.68 
 
 		 127 aa  193  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  88.68 
 
 		 127 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  88.68 
 
 		 127 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  88.68 
 
 		 127 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  88.68 
 
 		 127 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  88.68 
 
 		 127 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  88.68 
 
 		 127 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  88.68 
 
 		 127 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  88.68 
 
 		 127 aa  193  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  88.68 
 
 		 127 aa  193  8.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  89.32 
 
 		 130 aa  192  9e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  88.79 
 
 		 129 aa  191  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  88.35 
 
 		 130 aa  191  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  88.35 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  88.35 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  88.35 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  87.16 
 
 		 128 aa  190  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  85.85 
 
 		 128 aa  181  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  83.18 
 
 		 132 aa  179  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  85 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  81.31 
 
 		 131 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  81.31 
 
 		 131 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  82.24 
 
 		 130 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  82.24 
 
 		 132 aa  177  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  79.44 
 
 		 127 aa  176  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  86 
 
 		 131 aa  176  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  80.37 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  80.37 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  86 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  80.37 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  80.37 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0627  50S ribosomal protein L17  80.37 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.308367  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  85 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  85 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  85 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  84 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  79.05 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  77.57 
 
 		 126 aa  171  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  77.57 
 
 		 126 aa  171  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  83 
 
 		 131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4523  50S ribosomal protein L17  77.06 
 
 		 128 aa  169  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  77.06 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  77.06 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  77.06 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  81 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  77.06 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0652  ribosomal protein L17  76.15 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  77.78 
 
 		 127 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  77.14 
 
 		 127 aa  168  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5054  50S ribosomal protein L17  76.19 
 
 		 128 aa  166  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.088451  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  73.83 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3883  50S ribosomal protein L17  75.23 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  76.24 
 
 		 132 aa  164  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0863  50S ribosomal protein L17  74.77 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09130  50S ribosomal protein L17  74.77 
 
 		 129 aa  163  9e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06510  50S ribosomal protein L17  76.19 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  76 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  72.64 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  71.7 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  71.7 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0354  ribosomal protein L17  71.96 
 
 		 128 aa  160  4.0000000000000004e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.194755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  74 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  76 
 
 		 131 aa  160  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  76 
 
 		 132 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  76 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  76 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  73 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  73.74 
 
 		 119 aa  156  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  72.12 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  74 
 
 		 137 aa  156  9e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  74 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  70.09 
 
 		 126 aa  155  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  73.33 
 
 		 132 aa  156  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  75.76 
 
 		 131 aa  156  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2300  ribosomal protein L17  72.64 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  70.48 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  74 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  74.23 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  71.43 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  67.29 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  70.19 
 
 		 133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  70.48 
 
 		 134 aa  153  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  70.48 
 
 		 131 aa  153  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>