30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1028 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  100 
 
 		 641 aa  1339    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  27.34 
 
 		 726 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  24.49 
 
 		 727 aa  106  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  25.95 
 
 		 539 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  24.94 
 
 		 758 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3843  hypothetical protein  29.61 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.366486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  31.61 
 
 		 378 aa  60.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  32.5 
 
 		 277 aa  54.3  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  35.83 
 
 		 240 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3866  hypothetical protein  34.38 
 
 		 310 aa  51.2  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595881  normal  0.582727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  37.68 
 
 		 258 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  35 
 
 		 240 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  30.28 
 
 		 266 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  35 
 
 		 240 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  35 
 
 		 240 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  29.75 
 
 		 294 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  35 
 
 		 240 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  35 
 
 		 240 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  35 
 
 		 240 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  35 
 
 		 240 aa  48.9  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  35 
 
 		 240 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  32.59 
 
 		 383 aa  47.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  31.78 
 
 		 384 aa  47.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  35 
 
 		 240 aa  47.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  40.28 
 
 		 379 aa  47.4  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5752  lipase class 3  31.25 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0300845  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  33.98 
 
 		 299 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  28.7 
 
 		 324 aa  45.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7157  lipase class 3  39.71 
 
 		 291 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  30.51 
 
 		 336 aa  44.7  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>