40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3866 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3866  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  627  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595881  normal  0.582727 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  35.92 
 
 
378 aa  77  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  26.6 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  31.82 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  25.49 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  38.94 
 
 
294 aa  62.8  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  24.88 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  27.89 
 
 
240 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  27.89 
 
 
240 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  27.08 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  36.15 
 
 
641 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1267  lipase, class 3  27.47 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6230  lipase class 3  33.33 
 
 
344 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  26.32 
 
 
240 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  27.5 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  26.32 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  26.32 
 
 
240 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  25.79 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  25.79 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  35.64 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  25.79 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  25.79 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  25.79 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  33.61 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  31.29 
 
 
387 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  31.29 
 
 
387 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  31.68 
 
 
336 aa  49.3  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  30.5 
 
 
379 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05681  hypothetical protein  27.2 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  29.41 
 
 
383 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0603  lipase, class 3  36.26 
 
 
319 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000058  lipase-related protein  29.81 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37711  predicted protein  25.94 
 
 
359 aa  46.2  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  28.08 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3843  hypothetical protein  30 
 
 
381 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.366486  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01560  lipase-related protein  33.72 
 
 
262 aa  43.5  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5235  lipase, class 3  34.85 
 
 
208 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50397  predicted protein  24.55 
 
 
891 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  27.54 
 
 
726 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  32.23 
 
 
404 aa  42.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>