44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2065 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  100 
 
 
324 aa  659    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  35.54 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92920  predicted protein  34.84 
 
 
507 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.728823  normal  0.207195 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46753  predicted protein  27.31 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00406478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  34.81 
 
 
758 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  34.09 
 
 
276 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  31.34 
 
 
539 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  29.92 
 
 
357 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  35.38 
 
 
378 aa  62.8  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000058  lipase-related protein  33.33 
 
 
216 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.161375  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  36.13 
 
 
336 aa  59.3  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  29.7 
 
 
294 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01560  lipase-related protein  31.19 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  30.94 
 
 
726 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1267  lipase, class 3  30.22 
 
 
261 aa  56.6  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05681  hypothetical protein  29.63 
 
 
271 aa  56.2  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  33.09 
 
 
727 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0692  lipase, class 3  23.04 
 
 
276 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141463  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  29.37 
 
 
234 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  28.57 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  29.61 
 
 
404 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3843  hypothetical protein  26.42 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.366486  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  32.95 
 
 
258 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  31.01 
 
 
383 aa  49.7  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  28.49 
 
 
240 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17468  predicted protein  31.16 
 
 
1097 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  28.35 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  28.35 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  28.35 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  27.93 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  29.05 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  28.35 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  31.54 
 
 
240 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  30.83 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  29.05 
 
 
240 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  30.08 
 
 
387 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  27.84 
 
 
240 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  30.08 
 
 
387 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  30 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5235  lipase, class 3  35.77 
 
 
208 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  28.7 
 
 
641 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0918  hypothetical protein  31.48 
 
 
210 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  30.3 
 
 
379 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>