36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004314 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  100 
 
 		 379 aa  785    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  38.52 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  33.84 
 
 		 383 aa  209  9e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3843  hypothetical protein  30 
 
 		 381 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.366486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  30 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  34.09 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  33.56 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  33.1 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  33.1 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  33.1 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  33.1 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  33.1 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  33.1 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  33.1 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  33.1 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  32.41 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  31.72 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  31.68 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  31.03 
 
 		 726 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  33.82 
 
 		 539 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  28.57 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  28.57 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  29.14 
 
 		 234 aa  50.4  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  33.04 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  26.12 
 
 		 727 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  30.7 
 
 		 276 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29272  predicted protein  27.56 
 
 		 550 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  40.28 
 
 		 641 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  28.92 
 
 		 299 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000058  lipase-related protein  30.25 
 
 		 216 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28505  triacylglycerol lipase precursor  26.64 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  42.86 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1267  lipase, class 3  26.62 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  28.89 
 
 		 758 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05681  hypothetical protein  31.09 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  32.35 
 
 		 308 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>