32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3132 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  100 
 
 		 383 aa  797    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  35.43 
 
 		 384 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  33.84 
 
 		 379 aa  209  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3843  hypothetical protein  29.77 
 
 		 381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.366486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  31.11 
 
 		 240 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  30.56 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  30.17 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  31.3 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  31.11 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  31.61 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  31.61 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  31.61 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  31.61 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  30.97 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  30.97 
 
 		 240 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  30.97 
 
 		 240 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  32.06 
 
 		 727 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  33.1 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  33.33 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  34.06 
 
 		 726 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  32.39 
 
 		 299 aa  57  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  31.65 
 
 		 758 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  26.15 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  28.48 
 
 		 294 aa  50.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  31.01 
 
 		 324 aa  49.7  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  32.59 
 
 		 641 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28505  triacylglycerol lipase precursor  29.86 
 
 		 350 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46753  predicted protein  29.82 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00406478  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5752  lipase class 3  23.47 
 
 		 512 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0300845  normal  0.133238 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  23.08 
 
 		 266 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0692  lipase, class 3  24.38 
 
 		 276 aa  43.5  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>