51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3943 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  100 
 
 
539 aa  1111    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  58.98 
 
 
758 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  52.85 
 
 
727 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  37.19 
 
 
726 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  25.11 
 
 
641 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  35.81 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  30.92 
 
 
357 aa  72.8  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  33.99 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  33.09 
 
 
294 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  34.75 
 
 
240 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  34.23 
 
 
240 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  34.23 
 
 
240 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  34.23 
 
 
240 aa  65.1  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  34.23 
 
 
240 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  34.23 
 
 
240 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  34.23 
 
 
240 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  34.72 
 
 
240 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  29.3 
 
 
324 aa  63.9  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  33.56 
 
 
240 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  32.26 
 
 
240 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24393  predicted protein  31.82 
 
 
694 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  32.88 
 
 
240 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  33.55 
 
 
234 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  35.61 
 
 
384 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  30.57 
 
 
404 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28505  triacylglycerol lipase precursor  29.52 
 
 
350 aa  57.8  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  30.56 
 
 
276 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  34.81 
 
 
383 aa  57.4  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  30 
 
 
299 aa  57.4  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  32.43 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  32.43 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  28.76 
 
 
308 aa  55.1  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  32.85 
 
 
266 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  34.01 
 
 
336 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41624  predicted protein  25.47 
 
 
596 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.263212  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  33.82 
 
 
379 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  25.95 
 
 
258 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60390  triacylglycerol lipase  31.13 
 
 
313 aa  50.8  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3843  hypothetical protein  31.43 
 
 
381 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.366486  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08743  lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02710)  32.28 
 
 
1152 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.990446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7157  lipase class 3  27.03 
 
 
291 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5346  lipase class 3  37.04 
 
 
343 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.113059 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43593  predicted protein  36.36 
 
 
448 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.131498  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1579  lipase class 3  32.99 
 
 
490 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31492  predicted protein  27.4 
 
 
546 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50397  predicted protein  24.75 
 
 
891 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0603  lipase, class 3  28.22 
 
 
319 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17468  predicted protein  27.61 
 
 
1097 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05681  hypothetical protein  24.29 
 
 
271 aa  44.3  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29272  predicted protein  30.3 
 
 
550 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33194  predicted protein  37.08 
 
 
672 aa  43.9  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>