43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1892 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1892  lipase, class 3  100 
 
 
378 aa  784    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.184018  hitchhiker  0.008794 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2407  lipase family protein  35.34 
 
 
357 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0583209  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0075  lipase family protein  38.26 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3943  lipase family protein  33.99 
 
 
539 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0816  lipase, class 3  33.09 
 
 
726 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.229275  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004314  predicted lipase  30 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3866  hypothetical protein  33.8 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595881  normal  0.582727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0870  lipase, class 3  34.07 
 
 
384 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1781  lipase family protein  28.78 
 
 
277 aa  63.5  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4704  lipase class 3  33.56 
 
 
240 aa  63.5  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5022  lipase family protein  31.4 
 
 
240 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3485  lipase family protein  28.08 
 
 
758 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0992541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4756  lipase family protein  33.56 
 
 
240 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4594  lipase  33.56 
 
 
240 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0532925  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4616  lipase  33.56 
 
 
240 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5117  lipase family protein  33.56 
 
 
240 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.611246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4974  lipase family protein  33.56 
 
 
240 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2065  lipase class 3  35.38 
 
 
324 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4993  lipase family protein  33.8 
 
 
240 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.144902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5004  lipase family protein  33.56 
 
 
240 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0244  lipase family protein  33.1 
 
 
240 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00506661  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2380  lipase class 3  25.11 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2431  lipase class 3  25.11 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08046  extracellular lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02040)  30.86 
 
 
294 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1028  hypothetical protein  31.61 
 
 
641 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05777  extracellular triacylglycerol lipase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06510)  30.99 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10321  predicted protein  31.03 
 
 
234 aa  59.3  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000376906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0149  lipase, class 3  32.03 
 
 
727 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0272  lipase, class 3  31.85 
 
 
266 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0752  lipase class 3  27.41 
 
 
258 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3499  lipase class 3  29.17 
 
 
240 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.304459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1685  lipase, class 3  29.17 
 
 
276 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28505  triacylglycerol lipase precursor  27.01 
 
 
350 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10605  conserved hypothetical protein  27.45 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3132  lipase, class 3  26.15 
 
 
383 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.95393  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3843  hypothetical protein  30.99 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.366486  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_24393  predicted protein  25.6 
 
 
694 aa  49.7  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17468  predicted protein  24.3 
 
 
1097 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1065  galactose-1-phosphate uridyl transferase, class I  29.25 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228274  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1267  lipase, class 3  25.32 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5235  lipase, class 3  29.85 
 
 
208 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41624  predicted protein  25.64 
 
 
596 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.263212  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0603  lipase, class 3  30.06 
 
 
319 aa  43.1  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>