49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0366 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0366  accessory colonization factor AcfC  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1760  porcine attaching-effacing associated protein  50.41 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000702391  normal  0.0238437 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0337  major antigenic peptide PEB3  53.97 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0315  major antigenic peptide PEB3  53.97 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1380  major antigenic peptide PEB3  51.46 
 
 		 249 aa  249  4e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2270  hypothetical protein  39.36 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4641  extracellular solute-binding protein  43.29 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00556  accessory colonization factor  41.81 
 
 		 265 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0399  extracellular solute-binding protein family 1  36.86 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3615  hypothetical protein  35.48 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.520257  hitchhiker  0.00533129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2390  AcfC-like protein  38 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6952  hypothetical protein  32.94 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.75245 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0799  major antigenic peptide PEB2  33.99 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.646416  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0869  major antigenic peptide PEB2  33.6 
 
 		 246 aa  122  8e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.572076  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0726  major antigenic peptide PEB2  30.08 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.1322  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0415  hypothetical protein  32.07 
 
 		 243 aa  102  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733023  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1619  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.09 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0273335  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1821  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.3 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1444  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.32 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.448205  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1425  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.71 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3319  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  27.08 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1334  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.99 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.36729  normal  0.0167209 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1528  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.98 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00368148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0259  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.64 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0538  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  28.57 
 
 		 345 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  27.1 
 
 		 336 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2326  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  29.81 
 
 		 334 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000119117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1826  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  26.98 
 
 		 340 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  26.97 
 
 		 337 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  26.25 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02518  ABC transporter sulfate binding protein  29.81 
 
 		 365 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  27.95 
 
 		 335 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  27.11 
 
 		 337 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0170  sulfate transporter subunit  26.61 
 
 		 329 aa  43.1  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  42.55 
 
 		 330 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1722  thiosulphate-binding protein  52.38 
 
 		 361 aa  43.5  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  31.31 
 
 		 807 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  26.25 
 
 		 339 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3787  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 358 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0723  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  60.71 
 
 		 329 aa  42.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  27.88 
 
 		 359 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3479  regulatory protein LysR  27.27 
 
 		 373 aa  42.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  25.15 
 
 		 331 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0193  molybdenum ABC transporter, substrate-binding protein  33.33 
 
 		 268 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4806  sulfate transporter subunit  27.88 
 
 		 331 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221787 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0384  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.46 
 
 		 260 aa  42  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  23.31 
 
 		 329 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  23.31 
 
 		 329 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>