89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1380 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1380  major antigenic peptide PEB3  100 
 
 		 249 aa  502  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0337  major antigenic peptide PEB3  74.4 
 
 		 250 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0315  major antigenic peptide PEB3  74.4 
 
 		 250 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1760  porcine attaching-effacing associated protein  52.24 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000702391  normal  0.0238437 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0366  accessory colonization factor AcfC  51.46 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4641  extracellular solute-binding protein  42.92 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2270  hypothetical protein  40.86 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00556  accessory colonization factor  41.92 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0399  extracellular solute-binding protein family 1  40.38 
 
 		 255 aa  185  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3615  hypothetical protein  36.75 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.520257  hitchhiker  0.00533129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2390  AcfC-like protein  35.69 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0726  major antigenic peptide PEB2  34.77 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.1322  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0869  major antigenic peptide PEB2  33.2 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.572076  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0799  major antigenic peptide PEB2  33.2 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.646416  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.75245 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0415  hypothetical protein  28.95 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733023  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1334  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.42 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.36729  normal  0.0167209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3447  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.36 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0208  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.23 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.726895  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1884  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.15 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1619  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.74 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0273335  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1978  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.8 
 
 		 323 aa  55.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.201567 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1974  type I restriction-modification system, M subunit  23.11 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1821  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.96 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.45 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3266  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.71 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0189  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.78 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1444  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.22 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.448205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1528  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.38 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00368148 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1020  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.02 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.73823  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0924  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.93 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1585  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.78 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0193  molybdenum ABC transporter, substrate-binding protein  24.56 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0221  molybdenum ABC transporter, molybdenum-binding protein  24.78 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0384  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.16 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2226  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.69 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2672  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.31 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5099  molybdenum ABC transporter, molybdenum-binding protein  24.78 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2178  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.14 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000275297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0228  molybdenum ABC transporter, molybdenum-binding protein  24.56 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1370  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.22 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.215303  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1736  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.56 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1798  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.88 
 
 		 268 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0410  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  23.49 
 
 		 356 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2847  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  23.61 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108269 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0245  molybdenum ABC transporter, molybdenum-binding protein  23.68 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3629  sulfate ABC transporter periplasmic sulfate-binding protein  26 
 
 		 363 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4604  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.1 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0043  periplasmic solute-binding protein, putative  27.38 
 
 		 336 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0219043  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0044  putative sulfate-binding protein  27.38 
 
 		 336 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0186  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.89 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0044  thiosulphate-binding protein  28.48 
 
 		 385 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0222  molybdenum ABC transporter, molybdate-binding protein  23.89 
 
 		 268 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0723  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  30.19 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1183  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  26.44 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2901  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.76 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2473  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.48 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1425  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.32 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1480  ABC molybdate transporter, periplasmic ligand binding protein  22.33 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  24.18 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0085  putative sulfate-binding protein  25.93 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372808  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1094  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.78 
 
 		 258 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2326  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  26.25 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000119117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.83 
 
 		 329 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0997  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  23.78 
 
 		 335 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.961901  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4714  thiosulphate-binding protein  26.5 
 
 		 381 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.217544  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1307  molybdate-binding protein  23.74 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1400  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  32.26 
 
 		 339 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3094  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  25.96 
 
 		 336 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2391  putative sulfate-binding protein  24.22 
 
 		 320 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3319  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.34 
 
 		 252 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  26.86 
 
 		 807 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3012  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  24.32 
 
 		 335 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.615219  normal  0.0264263 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3189  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  24.32 
 
 		 335 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.480893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3092  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  24.32 
 
 		 335 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0179342  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0649  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.66 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.0057193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3342  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.7 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0157241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1408  thiosulfate transporter subunit  23.94 
 
 		 345 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2769  thiosulfate transporter subunit  23.94 
 
 		 345 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135265 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1299  thiosulfate transporter subunit  23.94 
 
 		 345 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  23.78 
 
 		 337 aa  42.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  23.08 
 
 		 337 aa  42.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3599  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  24.32 
 
 		 335 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3292  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  23.78 
 
 		 335 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1099  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  23.78 
 
 		 335 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0587643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1066  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  22.7 
 
 		 335 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0167374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0065  thiosulfate ABC transporter, periplasmic thiosulfate-binding protein  23.24 
 
 		 333 aa  42  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0814  sulfate-binding protein  25.44 
 
 		 328 aa  42  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>