63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0399 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0399  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2270  hypothetical protein  64.63 
 
 
254 aa  334  7e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3615  hypothetical protein  53.85 
 
 
253 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.520257  hitchhiker  0.00533129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2390  AcfC-like protein  55.42 
 
 
259 aa  275  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0726  major antigenic peptide PEB2  45.87 
 
 
247 aa  202  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.1322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1760  porcine attaching-effacing associated protein  41.35 
 
 
248 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000702391  normal  0.0238437 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0799  major antigenic peptide PEB2  41.15 
 
 
246 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.646416  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0869  major antigenic peptide PEB2  40.74 
 
 
246 aa  185  7e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.572076  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1380  major antigenic peptide PEB3  40.38 
 
 
249 aa  185  8e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6952  hypothetical protein  40.82 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.75245 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0366  accessory colonization factor AcfC  36.86 
 
 
256 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4641  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0315  major antigenic peptide PEB3  35.8 
 
 
250 aa  170  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0337  major antigenic peptide PEB3  35.8 
 
 
250 aa  169  6e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0415  hypothetical protein  40.99 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733023  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00556  accessory colonization factor  39.22 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3266  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.85 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1619  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.77 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0273335  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1444  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.06 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.448205  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1334  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.67 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.36729  normal  0.0167209 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1821  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.77 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233518  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3447  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.27 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0208  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.03 
 
 
291 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.726895  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1585  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.4 
 
 
280 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.296141  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0384  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.76 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0259  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.1 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1978  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.4 
 
 
323 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.201567 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1528  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  22.73 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00368148 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2326  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  28.66 
 
 
334 aa  55.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000119117  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1757  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.55 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1020  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  25.55 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.73823  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3319  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.4 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0543133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2342  molybdate ABC transporter, molybdate-binding protein  20.15 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.237075  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2054  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.15 
 
 
256 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1319  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.42 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1884  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.01 
 
 
272 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1425  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.79 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1307  molybdate-binding protein  23.39 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3492  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  26.99 
 
 
377 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2961  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  26.01 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2338  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  28.71 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895899  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0924  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  24.82 
 
 
267 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0301  putative molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  24.43 
 
 
280 aa  46.2  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3052  putative molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  24.05 
 
 
286 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24075 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1519  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  28.22 
 
 
335 aa  45.4  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.059232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0538  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  25.16 
 
 
345 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3174  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  26.04 
 
 
377 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.45845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2782  ABC-type transport system, periplasmic component  21.34 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.3240399999999997e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1798  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.77 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0108001 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0584  molybdate ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  39.13 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1221  extracellular solute-binding protein family 1  34.88 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2226  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  21.69 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1762  thiosulphate-binding protein  27.44 
 
 
332 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.478994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01929  hypothetical protein  21.37 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.602419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2070  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
322 aa  42.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01940  putative glycosyltransferase WbbA  21.37 
 
 
248 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.559549  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1531  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  20.74 
 
 
271 aa  42.4  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0160343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2780  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  26.06 
 
 
372 aa  42.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0890  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  23.28 
 
 
297 aa  42  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.356678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1959  putative molybdenum ABC transporter, solute-binding protein  26.56 
 
 
285 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734999  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0866  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  26.32 
 
 
334 aa  42  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1543  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  26.22 
 
 
330 aa  42  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.513686  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4509  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  26.58 
 
 
257 aa  42  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>