More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2780 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2780  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  100 
 
 
372 aa  748    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3174  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  59.78 
 
 
377 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.45845  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3482  thiosulphate-binding protein  50.59 
 
 
345 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3495  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.59 
 
 
345 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.417748  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3545  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.59 
 
 
345 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3875  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.97 
 
 
341 aa  298  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.33215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2678  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.82 
 
 
345 aa  293  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.433642  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12428  lipoprotein (sulfate-binding) subI  45.07 
 
 
356 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2326  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  39.57 
 
 
334 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000119117  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1681  thiosulphate-binding protein  36.42 
 
 
350 aa  203  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235432  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3629  sulfate ABC transporter periplasmic sulfate-binding protein  34.1 
 
 
363 aa  193  4e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0538  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.03 
 
 
345 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4714  thiosulphate-binding protein  35.41 
 
 
381 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.217544  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2764  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  37.38 
 
 
361 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8377  normal  0.37323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4914  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  37.88 
 
 
346 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4715  thiosulphate-binding protein  38.58 
 
 
378 aa  186  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.250615  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2354  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  43.06 
 
 
344 aa  186  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0635849  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3492  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  33.94 
 
 
377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1722  thiosulphate-binding protein  34.45 
 
 
361 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3352  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  35.36 
 
 
348 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.59657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3454  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  35.51 
 
 
346 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2750  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  35.36 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1686  thiosulphate-binding protein  32.31 
 
 
341 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.863569  normal  0.139145 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3186  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  34.71 
 
 
352 aa  170  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0691326  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  38.71 
 
 
339 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  38.71 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  36.21 
 
 
342 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3094  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  33.33 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  35.53 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0259  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  31.23 
 
 
345 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.904874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1183  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  32.6 
 
 
336 aa  161  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  34.21 
 
 
329 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  34.21 
 
 
329 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  34.21 
 
 
329 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  34.21 
 
 
329 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  34.21 
 
 
329 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  35.71 
 
 
345 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  34.21 
 
 
329 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  34.21 
 
 
329 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  35.89 
 
 
356 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  40.08 
 
 
329 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  34.21 
 
 
329 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  39 
 
 
336 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  37.35 
 
 
329 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  34.21 
 
 
329 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  36.55 
 
 
329 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  37.35 
 
 
329 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  36.55 
 
 
329 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  40.42 
 
 
341 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  33.77 
 
 
329 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  36.55 
 
 
329 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  33.78 
 
 
329 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1826  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  33.75 
 
 
340 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  31.72 
 
 
359 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  37.86 
 
 
329 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0291  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  34.3 
 
 
335 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  38.78 
 
 
337 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2077  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  37.45 
 
 
341 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000402733  hitchhiker  0.00000000000000351214 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1450  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  38.11 
 
 
343 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.601582  normal  0.754893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  38.4 
 
 
329 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0308  sulfate-binding protein  32.48 
 
 
338 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  37.1 
 
 
346 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  36.03 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  36.48 
 
 
327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0044  thiosulphate-binding protein  29.78 
 
 
385 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  36.89 
 
 
337 aa  153  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0170  sulfate transporter subunit  37.97 
 
 
329 aa  153  4e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0120  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  38.11 
 
 
342 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4806  sulfate transporter subunit  36.29 
 
 
331 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000221787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  34.65 
 
 
337 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0107  sulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  34.65 
 
 
342 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  35.47 
 
 
337 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  37.04 
 
 
807 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  30.4 
 
 
329 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4554  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  38.46 
 
 
350 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0084  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 
336 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  35.95 
 
 
337 aa  149  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  33.01 
 
 
335 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2961  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  33.96 
 
 
338 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0563  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  33.22 
 
 
341 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201199  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1132  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  31.94 
 
 
372 aa  149  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0194  thiosulphate-binding protein  33.78 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648325  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5231  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  32.66 
 
 
335 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.297946  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5171  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  33 
 
 
342 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138843  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1629  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  35.66 
 
 
347 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482062  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02518  ABC transporter sulfate binding protein  38.66 
 
 
365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  38.46 
 
 
337 aa  146  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1638  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  36.04 
 
 
345 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.749782  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  36.44 
 
 
329 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  36.33 
 
 
332 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  36.21 
 
 
798 aa  146  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5078  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  32.66 
 
 
335 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151813  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0090  sulfate transporter subunit  33.76 
 
 
329 aa  146  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0866  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  33.09 
 
 
334 aa  146  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  37.55 
 
 
335 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  31.23 
 
 
328 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  34.01 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0089  sulfate transporter subunit  33.76 
 
 
329 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  36.03 
 
 
332 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0241  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  33.84 
 
 
331 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.276521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>