260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0241 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0241  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  100 
 
 
331 aa  689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.276521  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  69.51 
 
 
335 aa  478  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  62.9 
 
 
328 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.58 
 
 
356 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  63.55 
 
 
337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.98 
 
 
329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  65.48 
 
 
337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  60 
 
 
331 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3400  thiosulphate-binding protein  61.49 
 
 
354 aa  401  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  60.79 
 
 
329 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  63.23 
 
 
337 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  60.38 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.14 
 
 
341 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.01 
 
 
342 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.17 
 
 
359 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.05 
 
 
337 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.06 
 
 
331 aa  395  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  60.51 
 
 
329 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.84 
 
 
345 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  62.9 
 
 
335 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  59.68 
 
 
346 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.32 
 
 
339 aa  391  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  60.91 
 
 
335 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.65 
 
 
339 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  59.68 
 
 
336 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.76 
 
 
332 aa  388  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  60.78 
 
 
330 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  58.84 
 
 
327 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  58.95 
 
 
329 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  58.23 
 
 
329 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0122  thiosulfate binding protein  63.23 
 
 
337 aa  391  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964738  decreased coverage  0.00000712106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.09 
 
 
337 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1394  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.21 
 
 
338 aa  381  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2760  thiosulphate-binding protein  62.87 
 
 
329 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  61.76 
 
 
807 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  62.95 
 
 
329 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.06 
 
 
343 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  58.33 
 
 
329 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.33 
 
 
329 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1011  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.75 
 
 
351 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  60.39 
 
 
329 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1196  sulfate ABC transporter, sulfate/thiosulfate-binding protein  58.61 
 
 
351 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  60.39 
 
 
329 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  58.33 
 
 
329 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  60.71 
 
 
329 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  58.33 
 
 
329 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  58.33 
 
 
329 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1125  sulfate-binding protein  58.75 
 
 
351 aa  378  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  58.33 
 
 
329 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  60.91 
 
 
329 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  60.39 
 
 
329 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0563  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.52 
 
 
341 aa  378  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201199  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  58.33 
 
 
329 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  58.02 
 
 
329 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2077  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.83 
 
 
341 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000402733  hitchhiker  0.00000000000000351214 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  58.02 
 
 
329 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4554  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.58 
 
 
350 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  58.02 
 
 
329 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2345  thiosulphate-binding protein  56.71 
 
 
342 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6842  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  59.74 
 
 
332 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  58.62 
 
 
332 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1223  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.44 
 
 
358 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.69 
 
 
337 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3094  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.1 
 
 
336 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1209  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.38 
 
 
327 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1861  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.38 
 
 
345 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2013  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.38 
 
 
345 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1781  thiosulphate-binding protein  58.44 
 
 
344 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1044  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.53 
 
 
336 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1847  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.38 
 
 
345 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1698  sulfate/thiosulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  60.38 
 
 
345 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0701208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  60.46 
 
 
798 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1572  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.82 
 
 
344 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0806  sulfate/thiosulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  60.06 
 
 
345 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1773  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.68 
 
 
346 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.69 
 
 
337 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2480  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.26 
 
 
345 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1183  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.79 
 
 
336 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.36 
 
 
341 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0354  sulfate/thiosulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  60.06 
 
 
345 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.271086  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1636  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.22 
 
 
345 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.778191  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31720  Sulfate-binding precursor protein  58.69 
 
 
332 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1923  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.01 
 
 
339 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.436654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0620  thiosulphate-binding protein  56.92 
 
 
336 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000295034  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1517  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.39 
 
 
345 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1121  thiosulphate-binding protein  58.39 
 
 
345 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1497  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.39 
 
 
345 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1601  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.39 
 
 
345 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0628  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  60.19 
 
 
335 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3046  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.35 
 
 
341 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.398245  normal  0.0441493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1799  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.01 
 
 
356 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.689523  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4739  thiosulphate-binding protein  58.06 
 
 
345 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623695  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1629  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.55 
 
 
347 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482062  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0090  sulfate transporter subunit  57.72 
 
 
329 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02518  ABC transporter sulfate binding protein  56.4 
 
 
365 aa  363  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607163  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1578  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.06 
 
 
345 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5843  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.35 
 
 
341 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.302205  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0089  sulfate transporter subunit  57.41 
 
 
329 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4125  sulfate transporter subunit  59.09 
 
 
329 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0698  ABC transporter sulfate binding protein  58.96 
 
 
339 aa  362  6e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>